Er komen eilanden in het Markermeer waardoor er extra natuur ontstaat. Hierdoor wordt het gebied aantrekkelijk voor mens en dier waaronder bijvoorbeeld beschermde watervogels. Minister Schultz van Infrastructuur & Milieu stelt ook 15 miljoen euro beschikbaar voor dit project. Dit staat in een brief van staatssecretaris Dijksma aan de Tweede Kamer is verstuurd.
De Markerwadden is één van de projecten die in aanmerking komt voor het extra natuurgeld dat voor 2013 beschikbaar is. Natuurmonumenten heeft dit project voorgesteld en de provincies Flevoland, Noord-Holland steunen dit. Naast extra natuur voor mens en dier wordt de kwaliteit van het water verbeterd. Het slib dat nu voor troebel water zorgt, gaat gebruikt worden om de eilanden te maken. Daardoor wordt het water weer helder zodat onder andere de vogels het voedsel weer kunnen vinden. De verbetering van de ecologische en recreatieve kwaliteit van het Markermeer-IJmeer is één van de doelstellingen van het Rijk-regioprogramma Amsterdam-Almere-Markermeer (RRAAM). In RRAAM werken het Rijk, de provincies, Noord-Holland, Utrecht en Flevoland en de gemeenten Amsterdam en Almere samen om de drievoudige ambitie op het gebied van woningbouw, bereikbaarheid en ecologie in de Noordelijke Randstad vorm te geven.